این شرکت، فعالیت پالایشی خود را از سال ۱۳۵۸ با ظرفیت ۲۰۰ هزار بشکه در روز آغاز نمود. پالایشگاه اصفهان در سال های گذشته شاهد موفقیت های زیادی بوده است از جمله این موارد می توان به افزایش ۸۵ درصدی ظرفیت پالایشی خود در اوایل دهه ی شصت اشاره نمود. در حال حاضر این پالایشگاه با خوارکی در حدود ۳۷۸ هزار بشکه در روز در مدار تولید بوده و سهم ۲۴ درصدی از کل تولید فراورده های نفتی کشور را بر عهده دارد. پالایشگاه اصفهان ضمن تولید فرآورده های مختلف مورد نیاز کشور، تامین خوراک صنایع پایین دستی؛ پتروشیمی اصفهان، پتروشیمی اراک، نفت سپاهان، پالایش نفت جی و صنایع شیمیایی ایران (LAB) را به عهده دارد.
در این پالایشگاه به علت تامین خوراک نفتا و پلاتفرمیت پتروشیمی های مجاور و مجتمع پتروشیمی اراک، درصد استحصال بنزین موتور، پایین تر از معمول برای ترکیب فرآیندی این پالایشگاه بوده است. به همین منظور طی سال های گذشته با برنامه ریزی های به عمل آمده طرح مجتمع بنزین سازی به منظور احداث سه واحد:
- تصفیه ی هیدروژنی نفتای سبک و سنگین (NHT)
- تبدیل کاتالیستی با احیا مداوم (CCR)
- ایزومریزاسیون
در دستور کار قرار گرفت. با بهره برداری از سه واحد فوق ۳ میلیون لیتر به تولید روزانه ی بنزین این پالایشگاه افزوده می شود.